在著床和早期胚胎發(fā)育過程中，母體和胎兒組織間的免疫相容和免疫排斥是一個(gè)動(dòng)態(tài)平衡的過程，任何打擾因素打破了這種平衡，都可能導(dǎo)致生化妊娠。根據(jù)對(duì)生化妊娠病因的研究來看，以下幾方面與生化妊娠的發(fā)生密切相關(guān)。

1、子宮內(nèi)膜厚度與容受性：子宮內(nèi)膜是胚胎種植的“土壤”，是正常受孕的關(guān)鍵部位，內(nèi)膜厚度、形態(tài)及其容受性都影響著妊娠結(jié)局。

2、母體激素水平：母體內(nèi)各種激素對(duì)排卵、受精、著床各個(gè)過程都有一定影響，但激素水平和生化妊娠的相關(guān)機(jī)制目前尚不十分清楚。E2和LH與妊娠的結(jié)局關(guān)系密切，其濃度也影響生化妊娠的發(fā)生，就目前研究結(jié)果分析，E2過高或者過低均會(huì)影響生化妊娠的發(fā)生，因此確定臨界值尤為重要，此外LH也與生化妊娠有關(guān)，但母體激素作用機(jī)制尚不清楚，有待進(jìn)一步的研究。

3、卵子質(zhì)量：卵子質(zhì)量直接影響胚胎的質(zhì)量，從而與生化妊娠發(fā)生相關(guān)。

4、胚胎質(zhì)量：胚胎的質(zhì)量往往通過其種植能力與種植后的發(fā)育能力影響妊娠結(jié)局。

5、胚胎染色體：胚胎染色體對(duì)胚胎質(zhì)量存在一定的影響，但是對(duì)與生化妊娠的關(guān)系并不大。

6、其他：有研究表明生化妊娠與患者年齡及既往生化妊娠或流產(chǎn)史有關(guān)，免疫因素可能也是影響生化妊娠的發(fā)生因素。還有學(xué)者提出生化妊娠可能與男性年齡和精液質(zhì)量有關(guān)。